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Réactiver votre compte
Cette page s'adresse aux utilisateurs des clusters Summit2, Fuxi et Ompfront.
Les comptes présents sur ces clusters ont été recopiés sur la nouvelle frontale Summit2. Nous profitons de cette opération pour recenser les comptes qui utilisent réellement les ressources du cluster et nettoyer les comptes dormants.
1. Activer votre compte
Merci d'envoyer un mail à calcul@aero.obs-mip.fr en notifiant dans le corps du message la liste du/des compte(s) à réactiver et en spécifiant dans le sujet du mail :
[Summit2]ActivationCompte
2. Se connecter à summit2
Une fois que vous avez reçu la notification d'activation, vous pouvez vous connecter au cluster par ssh :
ssh summit2.aero.obs-mip.fr
en utilisant le compte activé et en spécifiant le mot de passe : summit2201X!
3. Problème de connexion ssh
Si votre connexion à summit2 échoue avec un message de la forme :
gazdi@aeropc98:~> ssh summit2.aero.obs-mip.fr @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ @ WARNING: REMOTE HOST IDENTIFICATION HAS CHANGED! @ @@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@@ IT IS POSSIBLE THAT SOMEONE IS DOING SOMETHING NASTY! Someone could be eavesdropping on you right now (man-in-the-middle attack)! It is also possible that a host key has just been changed. The fingerprint for the RSA key sent by the remote host is 4b:8d:89:fe:16:48:2e:7b:cf:28:7b:c5:b0:1f:5b:7d. Please contact your system administrator. Add correct host key in /home/gazdi/.ssh/known_hosts to get rid of this message. Offending RSA key in /home/gazdi/.ssh/known_hosts:160 You can use following command to remove all keys for this IP: ssh-keygen -R summit2.aero.obs-mip.fr -f /home/gazdi/.ssh/known_hosts RSA host key for summit2.aero.obs-mip.fr has changed and you have requested strict checking. Host key verification failed.
Suivez les indications fournies dans le message, à savoir, exécuter (sur votre station de travail) la commande :
ssh-keygen -R summit2.aero.obs-mip.fr -f ...
Il est conseillé de doubler la commande précédente en précisant l'adresse IP 195.83.22.32 de Summit2 :
ssh-keygen -R 195.83.22.32 -f ...
4. Changer votre mot de passe
Le mot de passe initial est identique pour tous : merci de le modifier sinon le compte sera verrouillé dans les jours qui viennent.
summit2:~> passwd Changing password for gazdi. (current) UNIX password: summit22013! New password: <my_new_passwd> Retype new password: <my_new_passwd> passwd: password updated successfully
5. Où sont mes fichiers ?
gazdi@summit2:~> ls -l total 12 drwxr-xr-x 2 gazdi MESO 4096 Jan 26 2013 bin drwxr-xr-x 3 gazdi MESO 4096 Oct 10 23:51 OLDHOME drwxr-xr-x 2 gazdi MESO 4096 Jul 11 16:37 public_html gazdi@summit2:~> ls -l OLDHOME/ total 4 drwxr-xr-x 58 gazdi MESO 4096 Oct 9 23:13 gazdi
TOUS les fichiers de votre ancien compte ont été installés dans le répertoire OLDHOME/<login_summit2> : nous vous laissons le soin de les déplacer dans votre $HOME.
6. Retrouver mes clés SSH
Si vous aviez configuré votre ancienne connexion SSH pour éviter d'avoir à saisir le mot de passe, il est possible de retrouver ce comportement en déplacant le repertoire $HOME/$OLDHOME/<login>/.ssh dans le $HOME. Exemple :
gazdi@summit2:~> mv OLDHOME/gazdi/.ssh $HOME gazdi@summit2:~> logout Connection to summit2 closed. gazdi@aeropc98:~> ssh summit2 gazdi@summit2:~>
7. Faut-il recompiler mes codes ?
Oui, nous vous le conseillons fortement, étant donné que la mise à jour système s'est accompagné d'une évolution des compilateurs gfortran et des librairies C. Veuillez consulter la page LogicielsSummit2 pour obtenir la liste des compilateurs et des librairies disponibles par la commande module.
7.1. Pour MesoNH
Comme la version par défaut de OpenMPI est passé de 1.4.3 a 1.6.3 il suffit juste de changer ces lignes a la fin de vos fichiers profile_mesonh...
- le chemin vers l'installation de OpenMPI
#export MPI_ROOT=/usr/local/open-mpi-142-ifort export MPI_ROOT=/usr/local/OpenMPI/1.6.3/ifort10.1.021
le chemin ver les librairies dynamique qui sont maintenant dans un repertoire lib64
#export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib:$LD_LIBRARY_PATH export LD_LIBRARY_PATH=$MPI_ROOT/lib64:$LD_LIBRARY_PATH
- ensuite recharge votre environnement mesonh comme d'habitude
cd ...../src
. ../conf/profile_mesonh{la_bonne_version}- en cas de problème vous pouvez essayer de détruire/recréer juste les anciens exécutable avec
make cleanprogmaster make
8. Aux utilisateurs de Fuxi et Ompfront
Prenez l'habitude d'utiliser la commande module (voir LogicielsSummit2) pour modifier votre environnement et choisir un compilateur et des librairies particulières.
La recopie de votre ancien .bashrc dans votre $HOME risque de ne pas fonctionner.
Vous retrouverez les ressources associées à votre précédent cluster Fuxi/Ompfront en sélectionnant les partitions Slurm ayant comme préfixe fuxi et omp (voir ListePartitions).
N'importe quel utilisateur du cluster est autorisé à soumettre un job dans la partition any (regroupant l'ensemble de tous les nœuds et limitée à 2 heures) dans la limite du raisonnable.